Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

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Length 1,094 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SEC24CP53992 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SEC24CP53992 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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SEC24CP53992 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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