Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23IPQ9Y6Y8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEC23IPQ9Y6Y8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC23IPQ9Y6Y8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23IPQ9Y6Y8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms