Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB23Q9ULC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB23Q9ULC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB23Q9ULC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB23Q9ULC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms