Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D2Q9NY47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D2Q9NY47 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNA2D2Q9NY47 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms