Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIPAS39Q9H9C1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VIPAS39Q9H9C1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VIPAS39Q9H9C1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VIPAS39Q9H9C1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms