Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC01600Q96MT4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC01600Q96MT4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC01600Q96MT4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms