Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNPC3Q96LT9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNPC3Q96LT9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNPC3Q96LT9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms