Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX38Q92620 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX38Q92620 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX38Q92620 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX38Q92620 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX38Q92620 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX38Q92620 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX38Q92620 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX38Q92620 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX38Q92620 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX38Q92620 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms