Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP2LQ8IYA6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CKAP2LQ8IYA6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP2LQ8IYA6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CKAP2LQ8IYA6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms