Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPARGC1BQ86YN6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PPARGC1BQ86YN6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms