Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC01551Q86U37 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC01551Q86U37 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01551Q86U37 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LINC01551Q86U37 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms