Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HDXQ7Z353 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDXQ7Z353 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDXQ7Z353 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDXQ7Z353 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDXQ7Z353 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms