Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LIAT1Q6ZQX7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LIAT1Q6ZQX7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LIAT1Q6ZQX7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms