Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MUC6Q6W4X9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MUC6Q6W4X9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MUC6Q6W4X9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
MUC6Q6W4X9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms