Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP25-1Q3LHN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP25-1Q3LHN0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms