Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKRN4PQ13434 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKRN4PQ13434 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKRN4PQ13434 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKRN4PQ13434 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms