Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 YOL163WYOL163W 510 nt6.22□□□□□ -1.41
SPE4Q12455 GUF1YLR289W 1938 nt6.22□□□□□ -1.41
SPE4Q12455 MSS116YDR194C 1995 nt6.22□□□□□ -1.41
SPE4Q12455 UIP5YKR044W 1332 nt6.22□□□□□ -1.41
SPE4Q12455 YMR279CYMR279C 1623 nt6.21□□□□□ -1.41
SPE4Q12455 NMD5YJR132W 3147 nt6.21□□□□□ -1.41
SPE4Q12455 ZWF1YNL241C 1518 nt6.21□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 KEL1YHR158C 3495 nt6.21□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.21□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 OAC1YKL120W 975 nt6.21□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 SGF29YCL010C 780 nt6.21□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 YIL055CYIL055C 1884 nt6.21□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 CNE1YAL058W 1509 nt6.2□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 CDC11YJR076C 1248 nt6.2□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 GLC8YMR311C 690 nt6.2□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 YBR027CYBR027C 333 nt6.2□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 MNN5YJL186W 1761 nt6.2□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 TEP1YNL128W 1305 nt6.2□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 RGD1YBR260C 2001 nt6.2□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 PYK2YOR347C 1521 nt6.2□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 YFR006WYFR006W 1608 nt6.19□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 SDH4YDR178W 546 nt6.19□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 RPT3YDR394W 1287 nt6.19□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 YHR140WYHR140W 720 nt6.19□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 GLN1YPR035W 1113 nt6.19□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 GUD1YDL238C 1470 nt6.19□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 BPL1YDL141W 2073 nt6.19□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 HSM3YBR272C 1443 nt6.18□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 RAD59YDL059C 717 nt6.18□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 MRC1YCL061C 3291 nt6.18□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 APM4YOL062C 1476 nt6.17□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 IFA38YBR159W 1044 nt6.17□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 VPS4YPR173C 1314 nt6.17□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 MPA43YNL249C 1629 nt6.17□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 VPS5YOR069W 2028 nt6.16□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 IMG1YCR046C 510 nt6.16□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 BCY1YIL033C 1251 nt6.16□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 AAT2YLR027C 1257 nt6.16□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 RPS28AYOR167C 204 nt6.16□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 RRS1YOR294W 612 nt6.16□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 HXT2YMR011W 1626 nt6.16□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 MKK1YOR231W 1527 nt6.15□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 VPS72YDR485C 2388 nt6.15□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 ECM14YHR132C 1293 nt6.15□□□□□ -1.42
SPE4Q12455 CSC1YLR241W 2349 nt6.15□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 AIM3YBR108W 2844 nt6.15□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 ARO10YDR380W 1908 nt6.15□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 WHI2YOR043W 1461 nt6.15□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 CUP2YGL166W 678 nt6.14□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 ERP5YHR110W 639 nt6.14□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 NHA1YLR138W 2958 nt6.14□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 KKQ8YKL168C 2175 nt6.13□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 MPC2YHR162W 390 nt6.13□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 VMA4YOR332W 702 nt6.13□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 HST3YOR025W 1344 nt6.13□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 AFG1YEL052W 1530 nt6.13□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 CDC10YCR002C 969 nt6.12□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 YDR187CYDR187C 519 nt6.12□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 RPE1YJL121C 717 nt6.12□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 TAE1YBR261C 699 nt6.12□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 GYP8YFL027C 1494 nt6.11□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 RVB2YPL235W 1416 nt6.11□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 PRP2YNR011C 2631 nt6.11□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.11□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 TSA1YML028W 591 nt6.11□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 MRPS12YNR036C 462 nt6.11□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 GUS1YGL245W 2127 nt6.11□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 FRS2YFL022C 1512 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 YMR027WYMR027W 1413 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 YPR196WYPR196W 1413 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 YKL153WYKL153W 510 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 ESC8YOL017W 2145 nt6.1□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 PAT1YCR077C 2391 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 CRF1YDR223W 1404 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 TRP1YDR007W 675 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 RPN11YFR004W 921 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 MSN2YMR037C 2115 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 YLL067CYLL067C 3618 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 PDR18YNR070W 4002 nt6.09□□□□□ -1.43
SPE4Q12455 CLB2YPR119W 1476 nt6.09□□□□□ -1.44
SPE4Q12455 CNM67YNL225C 1746 nt6.08□□□□□ -1.44
SPE4Q12455 YDL023CYDL023C 321 nt6.08□□□□□ -1.44
SPE4Q12455 CDC34YDR054C 888 nt6.08□□□□□ -1.44
SPE4Q12455 RPL7AYGL076C 735 nt6.08□□□□□ -1.44
SPE4Q12455 LDS1YAL018C 978 nt6.08□□□□□ -1.44
SPE4Q12455 VPS24YKL041W 675 nt6.08□□□□□ -1.44
SPE4Q12455 RPL7BYPL198W 735 nt6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 114.8 ms