Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 COM2YER130C 1332 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 BTN2YGR142W 1233 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 SFK1YKL051W 1062 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 PSY3YLR376C 729 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 RFA2YNL312W 822 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 YBR063CYBR063C 1215 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 ERO1YML130C 1692 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 MUM3YOR298W 1440 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 WHI4YDL224C 1950 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 CLG1YGL215W 1359 nt9.12□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 GID7YCL039W 2238 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 BUD31YCR063W 474 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 YER137CYER137C 447 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 BET3YKR068C 582 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 YLR280CYLR280C 351 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 YMR007WYMR007W 381 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 MED8YBR193C 672 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 SRP54YPR088C 1626 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 FRE6YLL051C 2139 nt9.11□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 RSC58YLR033W 1509 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 ENO1YGR254W 1314 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 NRG1YDR043C 696 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 OCA6YDR067C 675 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 SYF2YGR129W 648 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 PRP21YJL203W 843 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 YJR084WYJR084W 1272 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 SWM2YNR004W 441 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 RIM2YBR192W 1134 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 YCL002CYCL002C 792 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 RGL1YPL066W 1440 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 PTM1YKL039W 1572 nt9.1□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 BUD22YMR014W 1560 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 YCR108CYCR108C 192 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 QRI7YDL104C 1224 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 ARG82YDR173C 1068 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 SPR28YDR218C 1272 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 TIF2YJL138C 1188 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 TIF1YKR059W 1188 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 ALG14YBR070C 714 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 SSL2YIL143C 2532 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 KGD2YDR148C 1392 nt9.09□□□□□ -0.95
NCR1Q12200 ATG22YCL038C 1587 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 AI4Q0065 1671 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YDL162CYDL162C 357 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 CBS2YDR197W 1170 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 PHM8YER037W 966 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 CNN1YFR046C 1086 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 SAY1YGR263C 1275 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 POL32YJR043C 1053 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 IRC25YLR021W 540 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 SEC65YML105C 822 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 ELA1YNL230C 1140 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YOR199WYOR199W 330 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 SNX3YOR357C 489 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 snR31snR31 225 nt9.08□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 MTH1YDR277C 1302 nt9.07□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YIP5YGL161C 933 nt9.07□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 MRPL6YHR147C 645 nt9.07□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 COQ9YLR201C 783 nt9.07□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 PSH1YOL054W 1221 nt9.07□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt9.07□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 UGX2YDL169C 672 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 GTB1YDR221W 2109 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 TRS23YDR246W 660 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YEL028WYEL028W 462 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YGL132WYGL132W 336 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 NTR2YKR022C 969 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 NSE1YLR007W 1011 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 MRPL16YBL038W 699 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 SER1YOR184W 1188 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 EFM2YBR271W 1260 nt9.06□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 GPI18YBR004C 1302 nt9.05□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YDR366CYDR366C 399 nt9.05□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 RCN1YKL159C 636 nt9.05□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YHC1YLR298C 696 nt9.05□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 NMA1YLR328W 1206 nt9.05□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YPL108WYPL108W 507 nt9.05□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YLR446WYLR446W 1302 nt9.05□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 RPD3YNL330C 1302 nt9.05□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 ITT1YML068W 1395 nt9.04□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 SNX4YJL036W 1272 nt9.04□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YJL160CYJL160C 864 nt9.04□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 BUD20YLR074C 501 nt9.04□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 BLS1YLR408C 369 nt9.04□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YOL166CYOL166C 339 nt9.04□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 ATP20YPR020W 348 nt9.04□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 RPN14YGL004C 1254 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 DUO1YGL061C 744 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YKL123WYKL123W 381 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 HSH49YOR319W 642 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YBR053CYBR053C 1077 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YPR071WYPR071W 636 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 CTF18YMR078C 2226 nt9.03□□□□□ -0.96
NCR1Q12200 NOB1YOR056C 1380 nt9.02□□□□□ -0.97
NCR1Q12200 DPL1YDR294C 1770 nt9.02□□□□□ -0.97
NCR1Q12200 SRB5YGR104C 924 nt9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.8 ms