Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H3F3AP84243 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
H3F3AP84243 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
H3F3AP84243 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H3F3AP84243 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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