Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB38P57729 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB38P57729 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB38P57729 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB38P57729 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB38P57729 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB38P57729 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB38P57729 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB38P57729 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB38P57729 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB38P57729 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB38P57729 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB38P57729 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB38P57729 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB38P57729 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB38P57729 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB38P57729 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB38P57729 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB38P57729 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB38P57729 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB38P57729 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB38P57729 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB38P57729 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB38P57729 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB38P57729 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB38P57729 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB38P57729 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB38P57729 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB38P57729 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB38P57729 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB38P57729 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB38P57729 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB38P57729 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB38P57729 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB38P57729 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB38P57729 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB38P57729 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB38P57729 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB38P57729 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB38P57729 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB38P57729 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB38P57729 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB38P57729 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB38P57729 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB38P57729 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB38P57729 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB38P57729 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB38P57729 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB38P57729 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB38P57729 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB38P57729 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB38P57729 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB38P57729 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB38P57729 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB38P57729 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB38P57729 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB38P57729 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB38P57729 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB38P57729 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB38P57729 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB38P57729 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB38P57729 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB38P57729 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB38P57729 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB38P57729 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB38P57729 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB38P57729 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB38P57729 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB38P57729 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB38P57729 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB38P57729 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB38P57729 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB38P57729 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB38P57729 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB38P57729 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB38P57729 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB38P57729 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB38P57729 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB38P57729 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB38P57729 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB38P57729 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB38P57729 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB38P57729 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms