Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GRIA2P42262 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GRIA2P42262 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms