Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFEP18615 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFEP18615 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFEP18615 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFEP18615 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFEP18615 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NELFEP18615 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFEP18615 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFEP18615 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFEP18615 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFEP18615 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFEP18615 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFEP18615 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFEP18615 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NELFEP18615 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFEP18615 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFEP18615 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFEP18615 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFEP18615 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFEP18615 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NELFEP18615 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFEP18615 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFEP18615 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFEP18615 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFEP18615 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFEP18615 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NELFEP18615 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFEP18615 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFEP18615 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NELFEP18615 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFEP18615 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFEP18615 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFEP18615 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFEP18615 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NELFEP18615 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NELFEP18615 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFEP18615 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFEP18615 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NELFEP18615 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFEP18615 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFEP18615 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFEP18615 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NELFEP18615 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFEP18615 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFEP18615 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFEP18615 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFEP18615 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFEP18615 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFEP18615 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFEP18615 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFEP18615 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NELFEP18615 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFEP18615 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFEP18615 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFEP18615 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFEP18615 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFEP18615 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFEP18615 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NELFEP18615 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFEP18615 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFEP18615 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFEP18615 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFEP18615 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NELFEP18615 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NELFEP18615 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFEP18615 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFEP18615 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFEP18615 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFEP18615 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFEP18615 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NELFEP18615 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms