Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SETSIPP0DME0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SETSIPP0DME0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SETSIPP0DME0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms