Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
BRD4O60885 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
BRD4O60885 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRD4O60885 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRD4O60885 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRD4O60885 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRD4O60885 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRD4O60885 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRD4O60885 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
BRD4O60885 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
BRD4O60885 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
BRD4O60885 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BRD4O60885 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
BRD4O60885 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRD4O60885 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRD4O60885 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRD4O60885 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRD4O60885 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRD4O60885 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BRD4O60885 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BRD4O60885 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BRD4O60885 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
BRD4O60885 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BRD4O60885 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BRD4O60885 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
BRD4O60885 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
BRD4O60885 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
BRD4O60885 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
BRD4O60885 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
BRD4O60885 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BRD4O60885 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
BRD4O60885 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
BRD4O60885 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
BRD4O60885 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRD4O60885 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRD4O60885 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRD4O60885 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRD4O60885 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
BRD4O60885 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
BRD4O60885 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BRD4O60885 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
BRD4O60885 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRD4O60885 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRD4O60885 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRD4O60885 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRD4O60885 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
BRD4O60885 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
BRD4O60885 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
BRD4O60885 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRD4O60885 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRD4O60885 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRD4O60885 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRD4O60885 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRD4O60885 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
BRD4O60885 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
BRD4O60885 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
BRD4O60885 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
BRD4O60885 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
BRD4O60885 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
BRD4O60885 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRD4O60885 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
BRD4O60885 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
BRD4O60885 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
BRD4O60885 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRD4O60885 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRD4O60885 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRD4O60885 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
BRD4O60885 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRD4O60885 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRD4O60885 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRD4O60885 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BRD4O60885 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BRD4O60885 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BRD4O60885 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRD4O60885 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRD4O60885 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRD4O60885 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BRD4O60885 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
BRD4O60885 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRD4O60885 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRD4O60885 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRD4O60885 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BRD4O60885 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BRD4O60885 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BRD4O60885 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
BRD4O60885 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BRD4O60885 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BRD4O60885 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BRD4O60885 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms