Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RASA4O43374 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASA4O43374 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASA4O43374 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASA4O43374 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASA4O43374 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASA4O43374 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASA4O43374 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASA4O43374 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASA4O43374 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASA4O43374 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASA4O43374 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASA4O43374 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASA4O43374 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASA4O43374 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RASA4O43374 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASA4O43374 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RASA4O43374 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASA4O43374 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASA4O43374 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASA4O43374 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASA4O43374 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASA4O43374 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASA4O43374 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASA4O43374 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASA4O43374 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASA4O43374 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASA4O43374 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASA4O43374 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASA4O43374 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RASA4O43374 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RASA4O43374 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASA4O43374 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASA4O43374 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RASA4O43374 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RASA4O43374 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASA4O43374 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASA4O43374 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASA4O43374 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASA4O43374 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RASA4O43374 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASA4O43374 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASA4O43374 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RASA4O43374 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RASA4O43374 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASA4O43374 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASA4O43374 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASA4O43374 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASA4O43374 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RASA4O43374 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASA4O43374 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASA4O43374 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASA4O43374 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASA4O43374 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RASA4O43374 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RASA4O43374 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RASA4O43374 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASA4O43374 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASA4O43374 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASA4O43374 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASA4O43374 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASA4O43374 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RASA4O43374 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RASA4O43374 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RASA4O43374 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms