Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TO15178 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TO15178 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TO15178 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TO15178 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TO15178 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TO15178 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TO15178 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TO15178 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TO15178 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TO15178 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TO15178 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TO15178 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TO15178 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TO15178 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TO15178 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TO15178 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TO15178 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TO15178 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TO15178 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TO15178 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TO15178 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TO15178 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TO15178 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TO15178 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TO15178 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TO15178 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TO15178 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TO15178 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TO15178 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TO15178 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TO15178 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TO15178 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TO15178 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TO15178 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TO15178 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TO15178 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TO15178 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TO15178 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TO15178 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TO15178 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TO15178 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TO15178 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TO15178 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TO15178 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TO15178 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TO15178 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TO15178 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TO15178 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TO15178 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TO15178 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TO15178 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TO15178 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TO15178 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TO15178 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TO15178 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TO15178 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TO15178 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TO15178 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TO15178 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TO15178 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TO15178 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TO15178 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TO15178 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TO15178 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TO15178 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TO15178 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TO15178 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TO15178 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TO15178 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TO15178 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TO15178 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TO15178 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TO15178 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TO15178 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TO15178 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TO15178 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TO15178 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TO15178 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TO15178 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TO15178 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TO15178 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TO15178 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TO15178 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms