Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
RAPGEF2Q9Y4G8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
RAPGEF2Q9Y4G8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.85■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
RAPGEF2Q9Y4G8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
RAPGEF2Q9Y4G8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms