Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX24Q9Y343 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX24Q9Y343 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX24Q9Y343 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms