Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PNMA8BQ9ULN7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PNMA8BQ9ULN7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA8BQ9ULN7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms