Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CDK12Q9NYV4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
CDK12Q9NYV4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CDK12Q9NYV4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDK12Q9NYV4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms