Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VCX3BQ9H321 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VCX3BQ9H321 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VCX3BQ9H321 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms