Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAF4Q9BUZ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRAF4Q9BUZ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF4Q9BUZ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms