Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSG1Q9BU20 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSG1Q9BU20 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms