Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STAMBPL1Q96FJ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAMBPL1Q96FJ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAMBPL1Q96FJ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
STAMBPL1Q96FJ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STAMBPL1Q96FJ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
STAMBPL1Q96FJ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
STAMBPL1Q96FJ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STAMBPL1Q96FJ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STAMBPL1Q96FJ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms