Protein–RNA interactions for Protein: Q92985

IRF7, Interferon regulatory factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF7Q92985 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF7Q92985 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IRF7Q92985 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IRF7Q92985 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRF7Q92985 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IRF7Q92985 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms