Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKRD42Q8N9B4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKRD42Q8N9B4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKRD42Q8N9B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKRD42Q8N9B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms