Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNTD2Q8IXW0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNTD2Q8IXW0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNTD2Q8IXW0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.9 ms