Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC84Q86UT8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC84Q86UT8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC84Q86UT8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC84Q86UT8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.8 ms