Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RSPH3Q86UC2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RSPH3Q86UC2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RSPH3Q86UC2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RSPH3Q86UC2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms