Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPAINQ86UA6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RPAINQ86UA6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPAINQ86UA6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms