Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC00173Q6ZV60 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
LINC00173Q6ZV60 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00173Q6ZV60 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms