Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CASC2Q6XLA1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CASC2Q6XLA1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms