Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC41PQ6P2S7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TTC41PQ6P2S7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC41PQ6P2S7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC41PQ6P2S7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.5 ms