Protein–RNA interactions for Protein: Q5XLA6

CARD17, Caspase recruitment domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD17Q5XLA6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD17Q5XLA6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD17Q5XLA6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD17Q5XLA6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CARD17Q5XLA6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CARD17Q5XLA6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CARD17Q5XLA6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CARD17Q5XLA6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms