Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BROXQ5VW32 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BROXQ5VW32 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BROXQ5VW32 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms