Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP47Q5SQN1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP47Q5SQN1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms