Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DUSP28Q4G0W2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DUSP28Q4G0W2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DUSP28Q4G0W2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DUSP28Q4G0W2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.8 ms