Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTF1Q16619 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTF1Q16619 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTF1Q16619 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms