Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIBQ15653 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIBQ15653 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms