Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt8.57□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 CAR1YPL111W 1002 nt8.56□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 PRI2YKL045W 1587 nt8.56□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 GEF1YJR040W 2340 nt8.55□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 MDH3YDL078C 1032 nt8.54□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 HEM1YDR232W 1647 nt8.54□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 LOT6YLR011W 576 nt8.54□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 IRC11YOR013W 471 nt8.53□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.53□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.53□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 HRQ1YDR291W 3234 nt8.53□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 YHC3YJL059W 1227 nt8.53□□□□□ -1.04
DNF3Q12674 MLC1YGL106W 450 nt8.52□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 ADE17YMR120C 1779 nt8.51□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 MRPL13YKR006C 795 nt8.51□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 MEH1YKR007W 555 nt8.51□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 GCN3YKR026C 918 nt8.51□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt8.5□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt8.49□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 MRPL36YBR122C 534 nt8.49□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 CNE1YAL058W 1509 nt8.49□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 RDN5-2RDN5-2 119 nt8.49□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 RDN5-3RDN5-3 119 nt8.49□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 RDN5-4RDN5-4 119 nt8.49□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 RDN5-5RDN5-5 119 nt8.49□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 RRS1YOR294W 612 nt8.49□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt8.48□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 GAA1YLR088W 1845 nt8.48□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 BNA3YJL060W 1335 nt8.47□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 YRF1-2YER190W 5046 nt8.47□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 PHB1YGR132C 864 nt8.46□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 YKL031WYKL031W 414 nt8.46□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 YPL062WYPL062W 405 nt8.46□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 YCL041CYCL041C 495 nt8.46□□□□□ -1.05
DNF3Q12674 CCP1YKR066C 1086 nt8.46□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 SOG2YOR353C 2376 nt8.45□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 ERS1YCR075C 783 nt8.45□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 YNL190WYNL190W 615 nt8.45□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 NPP1YCR026C 2229 nt8.45□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 CCT3YJL014W 1605 nt8.45□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 DYS1YHR068W 1164 nt8.44□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 LAS17YOR181W 1902 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 YNL120CYNL120C 486 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 RGT2YDL138W 2292 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 NUP84YDL116W 2181 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 POB3YML069W 1659 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 GPB2YAL056W 2643 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 MSY1YPL097W 1479 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 GAT3YLR013W 426 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 ARR3YPR201W 1215 nt8.43□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 BDF2YDL070W 1917 nt8.42□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt8.42□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 HBN1YCL026C-B 582 nt8.41□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 EXG1YLR300W 1347 nt8.41□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 NUD1YOR373W 2556 nt8.41□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 YTP1YNL237W 1380 nt8.41□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 ATG33YLR356W 594 nt8.4□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 UBC11YOR339C 471 nt8.4□□□□□ -1.06
DNF3Q12674 YGR182CYGR182C 354 nt8.4□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 CDC34YDR054C 888 nt8.39□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 ALR1YOL130W 2580 nt8.38□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 COX9YDL067C 180 nt8.38□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 PRM10YJL108C 1152 nt8.38□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 YMR010WYMR010W 1218 nt8.38□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.37□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.37□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.37□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 YLR312CYLR312C 1197 nt8.37□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 XBP1YIL101C 1944 nt8.36□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 YDL114WYDL114W 927 nt8.36□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 CWC21YDR482C 408 nt8.36□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 MIA40YKL195W 1212 nt8.36□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 HAP3YBL021C 435 nt8.36□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 YEL068CYEL068C 333 nt8.35□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 POP5YAL033W 522 nt8.35□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 ICT1YLR099C 1185 nt8.35□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 GNP1YDR508C 1992 nt8.35□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 RAD24YER173W 1980 nt8.34□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 MDM31YHR194W 1740 nt8.34□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 YCK1YHR135C 1617 nt8.34□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 PEX13YLR191W 1161 nt8.34□□□□□ -1.07
DNF3Q12674 TSA1YML028W 591 nt8.34□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 MCH1YDL054C 1461 nt8.33□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 RRP4YHR069C 1080 nt8.33□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 LDS1YAL018C 978 nt8.33□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 RKI1YOR095C 777 nt8.33□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 YPR114WYPR114W 948 nt8.32□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 PAC10YGR078C 600 nt8.31□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 PAN6YIL145C 930 nt8.31□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 MTC1YJL123C 1437 nt8.31□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 COT1YOR316C 1320 nt8.31□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt8.3□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 ATP14YLR295C 375 nt8.3□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 PEX31YGR004W 1389 nt8.3□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 PMA2YPL036W 2844 nt8.3□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 RGD2YFL047W 2145 nt8.3□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 UTR4YEL038W 684 nt8.3□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 SQT1YIR012W 1296 nt8.3□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 AIM24YJR080C 1185 nt8.3□□□□□ -1.08
DNF3Q12674 ARC35YNR035C 1029 nt8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.9 ms